snakefmt

Formata arquivos Snakemake. Mais informações: https://github.com/snakemake/snakefmt.

  • Formata um Snakefile específico:

snakefmt caminho/para/snakefile

  • Formata todos os Snakefiles recursivamente em uma pasta específica:

snakefmt caminho/para/diretorio

  • Formata um arquivo usando um arquivo de configuração específico:

snakefmt --config caminho/para/config.toml caminho/para/snakefile

  • Formata um arquivo usando um comprimento máximo de linha específico:

snakefmt --line-length 100 caminho/para/snakefile

  • Exibe às mudanças que seriam realizadas sem realiza-las:

snakefmt --diff caminho/para/snakefile